É possível gerar no Linux , através do  md5sum ou do sha1sum ,  recursivamente , o hash de arquivos presentes em um diretório.

Se não há subdiretórios, basta:

md5sum um-diretorio-que-deseja-listar/*.*

Porém , num ponto com muitos subdiretórios, pode se usar:

(Para facilitar o trabalho , primeiramente, instale o comando tree.)

Debian/Ubuntu:

apt-get install tree …